長鏈非編碼RNA與mRNA在胰腺癌中的差異表達及其預后價值
作者：魏超; 張曉; 高杰 東南大學公共衛生學院; 江蘇南京210009
摘要：目的:對基因芯片表達匯編(GEO)數據庫和癌癥基因組圖譜(TCGA)數據庫中的胰腺癌數據進行生物信息學分析,探討長鏈非編碼RNA(lncRNA)與mRNA在胰腺癌中的差異表達和預后價值。方法:首先對GEO數據庫中的胰腺癌數據注釋獲得mRNA和lncRNA,并對芯片中的mRNA和lncRNA取交集獲得差異mRNA和lncRNA。然后對差異mRNA和lncRNA進行基因分析,同時對TCGA數據庫中胰腺癌的相關數據進行生存分析。結果:通過基因分析獲得與胰腺癌相關可信度高的差異mRNA 1147個,lncRNA 336個,通過基因本體(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)分析,構建lncRNA-mRNA共表達網絡、lncRNA-mRNApathway網絡、信號通路關系網絡及蛋白質相互作用網絡,結果證明mRNA和lncRNA對胰腺癌的發生發展有著重要影響;生存分析發現有12個lncRNA與胰腺癌的預后相關,分別是ATP1A1-AS1、CBR3-AS1、CTD-3080P12.3、FAM66D、FAM87A、FLJ38576、LINC00476、LINC00574、LINC01554、PYY2、LINC00857、OVOL1-AS1。結論:lncRNA對胰腺癌的發生發展及預后有顯著影響,有望為胰腺癌的靶向治療和預后評估提供新的治療靶點和分子標志物。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社。
癌變畸變突變雜志
癌變畸變突變雜志， 雙月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創新性，刊載內容涉及的欄目：專家述評、論著、信息、腫瘤防治、綜述等。于1989年經新聞總署批準的正規刊物。
- 統計源期刊
- 1-3個月審核