大豆2S清蛋白基因生物信息學分析
作者：王迪; 邱紅梅; 王曙明; 高淑芹; 馬曉萍; 王洋; 鄭大浩; 王躍強 延邊大學; 吉林延吉133000; 吉林省農業科學院大豆研究所/大豆國家工程研究中心; 吉林長春130033
摘要：2S清蛋白含有動物胰蛋白酶抑制劑及過敏原等多種具有生理活性的多肽,可引起特殊人群尤其是兒童的過敏反應,其編碼基因為LTP基因家族。為系統地分析2S清蛋白編碼基因,利用生物信息學分析方法獲得2S清蛋白基因的全序列、定位以及轉錄本等信息,鑒定了30個大豆LTP家族基因。基因定位結果表明:23. 33%基因在染色體上串聯排布,反映了該家族基因的串聯重復進化。通過基因功能注釋得到22個非特異性脂質轉運蛋白,1個類伸展素蛋白,4個脯氨酸蛋白,2個種子儲存2S清蛋白和1個雄蕊特殊蛋白。根據系統發育分析將這些蛋白分成3個類群。類群I有類伸展素蛋白、脯氨酸蛋白、雄蕊特殊蛋白和種子儲存2S清蛋白,類群II有16個非特異性脂質轉運蛋白,類群III有6個非特異性脂肪轉移蛋白。種子儲存2S清蛋白基因在種子發育中后期特異表達,表達量顯著高于其它同源基因。本研究為進一步研究其功能提供指導,為該類基因應用于大豆品質改良提供理論支撐。
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大豆科學雜志
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