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花生PDAT基因家族的全基因組生物信息學分析

作者:田海瑩; 單雷; 李新國; 郭峰; 張智猛; 孟靜靜; 萬書波; 彭振英 山東省農業科學院生物技術研究中心/山東省作物遺傳改良與生態生理重點實驗室; 山東濟南250100; 山東省花生研究所; 山東青島266100; 山東省農業科學院; 山東濟南250100

摘要:磷脂二酰甘油酰基轉移酶(phospholipids:diacylglycerol acyltransferase,PDAT)催化磷脂和二酰甘油反應,生成溶血磷脂和三酰甘油,是植物三酰甘油合成的關鍵酶之一。為了在全基因組水平上探究花生PDAT(AhPDAT)基因家族的特征,通過生物信息學方法,結合花生基因組和轉錄組數據對AhPDAT家族成員從系統進化、基因結構、表達模式以及可變剪接等方面進行系統分析。結果顯示,AhPDAT家族包含17個成員,不均勻分布于9條染色體上。系統進化分析發現,AhPDATs與大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起,親緣關系較近。基因結構分析顯示,AhPDATs基因具有2~8個外顯子,可編碼88~742個氨基酸。表達模式分析發現,AhPDATs家族成員組織表達多樣化,這種表達模式的差異表明它們功能分工的不同。同時,該家族基因還存在豐富的可變剪接類型。這些結果為今后進一步開展AhPDATs基因家族的功能研究提供參考,同時也為花生品質育種奠定了一定的理論基礎。

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花生學報雜志

花生學報雜志, 季刊,本刊重視學術導向,堅持科學性、學術性、先進性、創新性,刊載內容涉及的欄目:栽培生理、土壤肥料、花生遺傳育種、栽培生理、植物保護、貯藏加工、分析測試、產業化等。于1972年經新聞總署批準的正規刊物。

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