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計算生物學分析在基因組編輯研究中的應用

作者:王瀅; 熊義春; 陳佳; 楊力 中國科學院計算生物學重點實驗室、中國科學院-德國馬普學會計算生物學伙伴研究所、中國科學院上海生命科學研究院營養與健康研究院; 中國科學院大學; 上海200031; 上海科技大學生命科學與技術學院; 上海200031

摘要:基因組編輯是對基因組遺傳信息進行定向改造的技術,其中CRISPR/Cas系統是目前應用最廣泛的基因組編輯新技術。將先進的高通量測序以及相關計算生物分析應用于基因編輯研究,可進一步優化基因編輯效率和精度等檢測流程,實現對全基因組功能基因篩選的監測。同時,利用基于生物信息及機器學習和深度學習等新方法,可對向導RNA(gRNA)的高效設計和實現對編輯效果的預測。本文將對計算生物學分析在CRISPR/Cas基因編輯系統的應用及研究進展等進行概述。

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