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一株湖北HP-PRRSV分離株nsp2基因遺傳變異分析

作者:陳盛楠; 陳奎蓉; 趙雯娟; 楊永磊; 趙一蘋; 曹素芳 河南牧業經濟學院動物醫學院; 河南鄭州450046

摘要:為了解湖北地區豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的遺傳變異情況和分子流行病學情況,從湖北地區某豬場采集疑似病料進行處理,接種Marc-145細胞,待細胞發生病變后收獲病毒,提取病毒總RNA,應用RT-PCR法對PRRSV nsp2部分基因進行擴增,經序列測定,并與美洲株VR-2332、歐洲株Lelystad virus及國內各PRRSV分離株進行核苷酸及其推導的氨基酸進行同源性比較,并繪制系統進化樹。結果表明,經RT-PCR擴增獲得了PRRSV湖北分離株(命名為HDZZ1)的nsp2基因,核苷酸序列分析顯示,獲得的nsp2核苷酸與VR-2332的同源性為77.7%,與Lelystad virus的同源性為44.3%。其氨基酸與VR-2332的同源性為64.58%,與Lelystad virus的同源性為13.93%。證明所獲得PRRSV仍為美洲型。與我國分離的高致病性PRRSV毒株07BJ、BJ0708、GD、GDYC、HEB1、Henan-1、 HN- HW、HPBEDV、HUB1、HUN4、JXA1、SX-1、SX2009核苷酸同源性高達97.3%~98.8%,氨基酸同源性為 96.40%~ 98.8%,氨基酸序列分析結果顯示,Nsp2蛋白在222位和274-302位兩處出現了30個氨基酸的不連續缺失,其Nsp2蛋白的抗原表位發生了改變。系統發生樹結果表明, HDZZ1株與高致病性PRRSV毒株位于同一大分支中,與歐洲代表株(Lv)、美國NADC30株和國內NADC30-likeHNjz15株處于不同分支中。由此斷定,HDZZ1毒株為高致病性PRRSV毒株。

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