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摘要：目的分析旋毛蟲抗原刺激MCF-7乳腺癌細(xì)胞前后的差異表達(dá)基因,為乳腺癌的治療提供新的靶點(diǎn)及思路。方法利用Illumina HiSeq對旋毛蟲幼蟲抗原刺激前、后的MCF-7細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,通過cutadapt對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾,用RPKM(Reads Per Kilo bases per Million reads)方法計(jì)算基因表達(dá)量,以差異基因log2fold change≥1且FDR≤0.05篩選差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs),通過Gene Ontology(GO)數(shù)據(jù)庫、KEGG pathway數(shù)據(jù)庫對差異表達(dá)基因的功能和參與的信號(hào)通路進(jìn)行分析,利用qRT-PCR對差異表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證。 結(jié)果轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)過濾后分別得到51 617 374和44 494 010條有效序列,從中篩選出21個(gè)差異表達(dá)基因,與對照MCF-7細(xì)胞(CON組)相比,旋毛蟲抗原刺激的MCF-7細(xì)胞(AG組)有13個(gè)上調(diào)基因,8個(gè)下調(diào)基因。差異表達(dá)基因主要富集于分子結(jié)合、催化活性、細(xì)胞組分、胞膜組分、生物調(diào)節(jié)、細(xì)胞過程等,主要參與TGF-β、Jak-STAT、ErbB、Hippo、mTOR信號(hào)通路調(diào)節(jié)及碳代謝、氨基酸生物合成、丙氨酸-天冬氨酸-谷氨酸代謝、視黃醇代謝、甘氨酸-絲氨酸-蘇氨酸代謝及血管平滑肌收縮等。利用qRT-PCR對顯著下調(diào)基因受體活性修飾蛋白3(Receptor activity modifying protein 3,RAMP3)的表達(dá)進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序一致。 結(jié)論旋毛蟲抗原刺激導(dǎo)致MCF-7乳腺癌細(xì)胞RAMP3表達(dá)降低,RAMP3可能參與旋毛蟲抗原抗腫瘤過程。